Son chef, Oussama Ben Laden, le surnommait le «cerveau» de ses opérations. Khaled Cheikh Mohammed est l'ancien chef du comité militaire d'Al Qaïda et premier dirigeant militaire et responsable du Département des opérations extérieures de la même organisation. Connu sous le nom de Mukhtar, le présumé terroriste a été arrêté au Pakistan en 2003. Il est détenu au secret à Guantanamo depuis la date de sa capture. Il était toujours considéré par les Etats-Unis comme terroriste islamiste et numéro 3 d'Al Qaîda. Son chef, le dirigeant d'Al Qaîda, Oussama Ben Laden, le surnommait le «cerveau» de ses opérations. Agé de 41 ans, selon certaines informations, Cheikh Mohammed est né au Koweït ou au Pakistan, en 1965 présume-t-on. Cela explique le manque d'informations précises à son sujet. Il aurait, peut-être, suivant d'autres indications, suivi des cours dans une université américaine, avant de regagner le Pakistan, puis l'Afghanistan et devenir, par la suite, l'une des pièces maîtresses d'Al Qaîda. Le détenu de la CIA à Guantanamo a été arrêté au Pakistan le 1er mars 2003 au Pakistan. Il fait partie de la trentaine de ceux qu'on appelle «détenus fantômes» que la CIA maintient en secret dans son réseau de prisons secrètes hors des Etats-Unis, afin de les soustraire au système judiciaire américain. Un tribunal militaire, travaillant dans une sorte de totale discrétion, a été institué à l'encontre des «combattants ennemis». Avant la phase Guantanamo, Khaled Cheikh Mohammed aurait été détenu en Jordanie pour le compte des Etats-Unis et avait été remplacé par Abou Faraj al-Libbi, lui-même arrêté le lundi 2 mai 2005. En septembre 2006, soit trois ans après sa capture, le président américain, George W.Bush, a annoncé le transfert du détenu vers la prison de Guantanamo ainsi que le prochain jugement de 14 responsables du réseau d'Al Qaîda, dont Khaled Cheikh Mohammed. Les Etats-Unis d'Amérique avaient offert jusqu'à 25 millions de dollars de récompense pour toute information permettant la capture de Khaled Cheikh Mohammed. Une version permettant de sa capture, indique que Cheikh Mohammed, recherché alors, a été arrêté un premier mars 2003 alors qu'il dormait dans une maison de Rawalpindi, ville voisine de la capitale pakistanaise, Islamabad. L'on a laissé entendre qu'il se trouvait avec deux autres suspects qui ont également été capturés. L'un de ces hommes est Ahmed Abdul Qadoos, un Pakistanais membre du parti religieux Jamaât-e-Islami. Les trois hommes résidaient dans la maison du père d'Ahmed Abdul Qadoos. Khaled Cheikh Mohamed serait l'oncle de Ramzi Youssef, condamné aux Etats-Unis pour le premier attentat contre le World Trade Center en 1993. L'un de ses frères est aussi membre d'Al Qaîda, se référant à certaines autres informations diffusées par les services secrets américains. Un autre de ses frères a trouvé la mort au Pakistan dans l'explosion d'une bombe qu'il fabriquait. Khalid Cheikh Mohammed aurait été aussi impliqué dans l'enlèvement et l'assassinat du journaliste américain, Daniel Pearl, correspondant du Wall Street, en Asie du Sud. Un assassinat qu'il a revendiqué d'ailleurs, à en croire le compte-rendu du Pentagone, mais dont l'autorité militaire a censuré plusieurs passages. Plusieurs ONG humanitaires et de droits de l'homme, l'ONU et la communauté internationale, réclament sans cesse, la fermeture de Guantanamo, «prison de honte et de non-droit» ouverte en janvier 2002. Quelque 400 terroristes présumés sont toujours détenus, étiquetés de «combattants ennemis» par l'Administration Bush.
