Le pape, Benoît XVI, (avant d'être pape) et d'autres responsables du Vatican auraient couvert les abus sexuels d'un prêtre américain soupçonné d'avoir violenté environ 200 enfants d'une école de sourds dans le Wisconsin, selon des documents obtenus par Le New York Times. Ces documents provenant d'une action en justice sur cette affaire, font état d'une correspondance adressée par le prêtre Lawrence C. Murphy au cardinal Joseph Ratzinger en 1996, qui présidait la congrégation pour la doctrine de la foi, avant de devenir pape. Murphy travaillait dans cette école de 1950 à 1974. Cette affaire comprend des actions en justice contre l'archevéché de Milwaukee, entreprises par cinq hommes dont les avocats ont transmis au journal ces documents tenus longtemps secrets. Un procès secret devant un tribunal ecclésiastique contre le père Lawrence C. Murphy avait été stoppé après qu'il eut écrit à Joseph Ratzinger, le suppliant d'arrêter cette procédure. «Je veux simplement vivre le temps qui me reste dans la dignité de mon sacerdoce (…) Je demande votre aide dans cette affaire», écrit le révérend Murphy au cardinal Ratzinger. Aucune réponse de Joseph Ratzinger ne figure dans les documents, et Lawrence Murphy est mort deux ans plus tard, en 1998, alors qu'il était toujours prêtre. Les documents du Wisconsin montrent que trois archevêques de l'Etat savaient que Lawrence Murphy abusait d'enfants mais cela n'a jamais été rapporté aux autorités civiles. Le porte-parole du Vatican a déclaré au New York Times que cette nouvelle affaire était «tragique», estimant que le révérend Murphy abusait d'enfants «particulièrement vulnérables».
