La Cnep commence l'année 2009 avec un nouvel organigramme, effectif depuis ce début du mois et qui repose sur un schéma organisationnel bien particulier. En tête, le président-directeur général est directement secondé par un secrétaire général et pas moins de 6 directions générales adjointes, chacune chargée d'un portefeuille de directions centrales. Le secrétariat général est donc le plus proche du président, et ce, même si l'on observe que les organes de contrôle à l'image de l'inspection générale et de la structure de l'audit interne se détachent du lot pour être directement rattachés à l'autorité du premier responsable de la banque. Occupant un poste clé de par la nature de sa mission première, qui consiste à placer du crédit, la direction générale adjointe des crédits se trouve ainsi en bonne position dans cette hiérarchie. Le développement commercial, les ressources humaines et moyens, les risques, la comptabilité et finances, le juridique et contentieux ainsi que les crédits sont toutes des directions générales adjointes. Ce qui donne à leurs responsables respectifs plus d'envergure et surtout de responsabilité avec signature de valeur classée. Djamel Bessa Président-directeur général, avec statut de cadre de dirigeant principal. Natif d'Alger en 1957, cet universitaire titulaire d'une licence en droit et d'un magister en droit a également décroché un 3e cycle professionnel de banque et un diplôme de managment stratégique (HEC Paris). Enfant de la Cnep, il a été recruté en 1984 pour ensuite occuper des postes de responsabilité en passant par celui de directeur général adjoint, et conduire aujourd'hui la Cnep dans ses nouvelles missions. Rachid Atmani Secrétaire général de la CNEP, donc proche collaborateur du P-DG. Cet universitaire a rejoint la Cnep en 1983 et a déjà occupé le poste de directeur général adjoint. Rachid Belaïd Directeur général-adjoint, jeune universitaire, diplômé en sciences économiques et d'un 3e cycle professionnel, il est chargé de la fonction crédit à la Cnep où il a fait ses débuts dès le mois de février 1994.
