Mascara, de part sa situation géographique dans l'Ouest Algérien et sa vocation agro- pastorale, constitue un terrain privilégié pour des recherches multidisciplinaires. D'autant plus, l'université dispose d'un potentiel scientifique opté à prendre en charge des travaux de recherche dans différents domaines de l'agronomie, de la biologie de l'environnement, de l'économie, de la sociologie et de la technologie. Pour mener à bien sa mission de formation et de recherche et dans le but de créer une synergie et des complémentarités fonctionnelles entre les différentes spécialités, l'université de Mascara a contribué à l'effort national par la mise en place de quatre laboratoires de recherche ( Agrées en 2000 et en 2002) et la réalisation d'un centre de recherche, doté de tous les moyens nécessaires à la mobilisation des compétences de l'université, dont son démarrage est prévu pour octobre 2009 en fonction de la mise en place du réseau internet, il faut noter que d'importants moyens financiers du FNRSDT sont, mobilisés au niveau de ces laboratoires de recherche : 62.000.000 DA ( budget de fonctionnement pour la période triennale 2007-2009, 45 000 000 DA ( Budget d'équipement pour la période triennale 2007/2009) 29 000 000DA ( enveloppe Budgétaire octroyée à titre exceptionnel pour l'Acquisition du mobilier de laboratoire. Les équipements en informatiques et l'aménagement de l'environnement du centre de recherche sont réalisés dans le cadre du FNRSDT. L'agrément de deux nouveaux laboratoires de recherche en sciences sociales et en recherche en chimie) il y a également la prise en charge de vingt projets de recherche agrées dans le cadre des PNR (programmes nationaux de recherche) conformément aux deux lois (1998 et 2008) portant « orientation et programme à projection quinquennale sur la recherche scientifique et le développement technologique : 1998-2002 et 2008- 2013 » dans notre pays. Il y a également la prise en charge de trente projets de recherche CNEPRU ( MESRS) mobilisant 150 enseignants. Le montage de projets de coopération multilatérale Algéro-union Européenne ( Tempus) des projets de coopération bilatérale Algéro-Française ( CMEP et CNRS), Algéro-Espagnole ( PCI réseau vives-cruo), Algéro-Italienne ( changements climatiques globaux) des prestations au bénéfice d'institutions nationales ou internationales sur des thématiques diverses. Préservation de la biodiversité des parcs nationaux du Tassili et de l'Ahaggar ( ministère de la culture, PNUD et FEM-GEF), formation sur le PPDRI au niveau des wilayates de Mascara El Bayadh, Saida et Relizane, l'initiation de vingt et une formations post gradués dans différentes disciplines dont 245 soutenances de mémoires de magister ont étés réalisés à la date de mai 2009 et 271 étudiants finalisent actuellement leurs recherches. L'université de Mascara a l'Agrément à inscrire et délivrer le diplôme de docteur en sciences et de professeur habilité (doctorat d'état) dans les spécialités en sciences de la vie et « sciences de la terre et de l'univers » cet agrément a été mis en œuvre dès la rentrée universitaire 2008/2009 avec 53 inscriptions en doctorat et 3 demandes d'habilitation universitaire. Pour atteindre les objectifs de la recherche scientifique, des efforts très importants sont consentis en matière de formation et de perfectionnement à l'étranger ; en moyenne 10 bourses de 18 mois et 220 stages d'un mois sont octroyés annuellement à l'université. Globalement dans le domaine de la recherche scientifique et de la formation post graduée des résultats intéressants tant sur le plan scientifique que pratique ont été réalisés au niveau de l'université de Mascara. Les efforts ainsi consentis s'insèrent dans un double objectif, d'une part mobiliser les compétences de l'université autour de thèmes d'études ou de recherches selon une orientation scientifique pour atteindre parfaitement aux objectifs des P.N.R qui, rappelons le, doivent essentiellement avoir des retombées socio-économiques pour le développement de notre pays. D'autre part former à travers les formations post graduées en place, des spécialités nécessaires au démarrage et à l'encadrement de certaines filières de graduation au niveau de l'université. Les résultats obtenus durant ces cinq dernières années ont comblé, en bonne partie, les déficits en enseignants dans au moins trois spécialités : Agronomie, biologie et sciences économiques, enfin, il est à préciser que, au vu de ces résultats l'université de Mascara a été érigée en pôle d'excellence dans les domaines de recherche de l'Agronomie, de la biologie, des sciences de la nature et par conséquent l'établissement a bénéficié d'une opération portant sur l'étude et la réalisation d'un centre national de recherche en agro-polis.
