Eu égard à sa situation géographique privilégiée et à sa vocation agropastorale, Mascara s'avère comme étant un pole idéal pour la recherche multidisciplinaire. Cette option est favorisée par l'avantage que constitue l'université, structure qui dispose d'un potentiel scientifique apte à prendre en charge les travaux de recherche dans les différents domaines comme l'agronomie, la biologie, l'environnement, l'économie, la sociologie ou la technologie. Afin de mener à bien sa mission liée à la formation et à la recherche, et dans le but de créer une synergie et des complémentarités fonctionnelles entre les différentes spécialités, l'université de Mascara a contribué à l'effort national par la mise en place de quatre laboratoires de recherche qui ont été agréés en 2000 et 2002 et par la réalisation d'un centre de recherches doté de tous les moyens nécessaires et la mobilisation des compétences de l'université dont le démarrage est programmé pour le mois d'octobre de l'année en cours. La concrétisation de cet objectif est conditionnée par la mise en place du réseau approprié et l'engagement d'importants moyens financiers FNRSDT au niveau de ces laboratoires de recherche dont 62 000 000 DA pour le budget de fonctionnement et 45 000 000 DA pour le budget d'équipement, des dépenses qui s'étalent sur une période de trois années 2007-2009 ainsi qu'une enveloppe budgétaire de l'ordre de 29 000 000 DA octroyée à titre exceptionnel pour l'acquisition du mobilier du laboratoire, des équipements en informatique et l'aménagement de l'environnement du centre de recherches. Dans ce contexte, l'université de Mascara a bénéficié de l'agrément de deux nouveaux laboratoires de recherche l'un en sciences sociales et l'autre en chimie ainsi que la prise en charge de vingt projets de recherche lancés dans le cadre des programmes nationaux de recherche conformément aux dispositions des deux lois de 1998 et 2008 portant orientation et programme à projection quinquennale sur la recherche scientifique et le développement technologique dans notre pays. Il y a également la prise en charge de trente projets de recherche qui ont nécessité la mobilisation de 150 enseignants chargés du montage des projets de coopération multilatérale, algéro-union européenne (Tempus), algéro-française (CMEP et CNRS), algéro-espagnole (PCI, réseau Vives, Cruo), algéro-italienne (changements climatiques globaux), des prestations au profit des institutions nationales ou internationales sur les thématiques diverses.L'université de Mascara est agréée pour procéder à l'inscription et à la délivrance du diplôme de docteur en sciences et de professeur habilité (docteur d'Etat) dans les spécialités sciences de la vie et sciences de la terre et de l'univers. Cet agrément a été mis en œuvre dès la rentrée universitaire 2008/2009 avec 53 inscriptions en doctorat et 3 demandes d'habilitation universitaire. Pour atteindre les objectifs de la recherche scientifique, des efforts très importants sont consentis en matière de formation et de perfectionnement à l'étranger avec en moyenne 10 bourses de 18 mois et 220 stages de 1 mois octroyés annuellement à l'université.
